清华信息科学技艺国度实验室集成3个国度要点实验室和2个熟练部要点实验室，结束了顶层统筹和资源逼近；依托4个一级学科重组实验室的商议体系，加多复杂散播式收集抑制、测度机体紧缚构等商议所在；磋磨校表里科技上风、部署并强化新的商议所在，如网格技艺、信息安全、量子信息学、纳电子学等。初步酿成了实验室的商议架构姐妹花 双飞，国度实验室延伸理事会结合下的主任负责制，成立了结合班子，确立了测度机科学与东谈主工智能商议部、通讯系统与收集商议部、光电子学商议部、自动化科学与技艺商议部、微纳电子学商议部、下一代互联网商议部、网格测度商议部、普适测度商议部、生物信息学商议部、全国平台与技艺部、基础转变与开发部、信息发展计谋商议中心等5个面向基础学科商议部、4个面向新兴与交叉学科的商议部、1个面向全国平台与技艺的平台、1个技艺转变与开发部。建立了基于ISO90001的全国做事的质地管制体系、限定轨制扶助日常脱手。

　　完成了中心实验室建立。清华大学自筹集资金1.6亿，建成占地1.89公顷、总建筑面积为36000宽泛米的信息科技大楼已拜托清华信息科学与技艺国度实验室使用，结束了实验室主体相对逼近，斡旋排政做事和资源退换。洽商到大型开拓等基础技艺，在学校东主楼和微电子所成立了分实验室。

　　网格测度商议部通过建立全国平台，结束怒放、分享，体履行验室的国度包袱。建立科学测度平台、信息收集平台、电子测试平台、EDA缱绻平台4个全国技艺平台以及先进东谈主机交互系统平台、通讯系统与收集实验平台、微纳结构与器件制备和测试平台、复杂收集化系统商议平台4个专科技艺商议平台。在平台建立中，体现了运用国度实验室框架在更大领域内进行资源整合的上风。如在科学测度平台建立中，废弃原已订货采购的64节点32位测度机，实验室统筹诀别的资源，再行采购128节点64位测度机，通过捐赠等门径科罚存储开拓和部分软件。此平台已于2005年7月肃穆对外提供怒放做事。